Abstract: The seedling traits is a simple and non-destructive methodology used to identify haploids/diploids in maize. This study aimed at establishing an optimal germination temperature to evaluate this methodology and verify its effectiveness. Haploid and diploid seeds, obtained from crosses with the haploidy inducer TAIL9, were classified using the R1-Navajo marker and placed to germinated in growth chambers maintained at different temperatures. After 96 h, radicle and coleoptile lengths and the number of lateral seminal roots were determined. Cut-off points for these traits were established using Receiver Operating Characteristic curves and a new haploid/diploid classification was performed and compared to the plant phenotype (gold standard) to obtain false discovery rates and false negative rates. The seedling traits methodology successfully differentiated haploids and diploids, proving to be effective in eliminating false positives, selected by the R1-Navajo marker. The temperature of 30 °C was established as the optimal germination temperature for this study.

ABSTRACT. We investigated regression models with mixed effects using generalized linear statistics to evaluate germination data from Stevia rebaudiana (Bert) Bertoni. Estimates and validation of statistical parameters were conducted using the “gamlss” package in the R software. Generalized linear mixed effects followed the binomial, the beta-binomial and the multinomial distribution with the logit link to explain data based on the following explanatory variables: seed germinator, plastic tray position on every tier of shelves, illuminance conditions (light and darkness) and seed lots. We did not find differences in proportional responses from seed germinators, but we did find differences in the illuminance conditions, plastic tray position on the tiers of shelves in the seed germinators and seed lots. The estimates of the generalized Akaike information criterion (GAIC), Akaike information criterion (AIC), global deviance (GD) and Bayesian information criterion of Schwarz (BIC) indicate similar goodness-of-fit for the binomial and beta-binomial models. All of the models indicate that the position of the germination tray on every tier of shelves and illuminance conditions affected the proportions of normal seedlings. The seed germination in the plastic tray on the uppermost position under fluorescent day light lamps had an effect on the proportion of normal seedlings of Stevia.

RESUMO. O fator mais importante para que os agricultores possam cultivar Stevia rebaudiana is a produção qualitativa de mudas. Assim, o objetivo destes experimentos foi o de avaliar a influência do “priming” na uniformidade das ocorrências germinativas. Primeiro, nós avaliamos a porcentagem de plântulas normais de duas amostras colhidas nos anos 2011 e 2012. As sementes colhidas no ano de 2012 desenvolveram 71,4% de plântulas normais, e por isso foram usadas nos demais experimentos. Depois, as sementes foram estressadas osmoticamente usando cinco concentrações de polietileno glicol (PEG-6000) -0,2; -0,4; -0,6; -0,8 e -1,0 MPa, juntamente com um controle com água destilada. Com base nestes resultados, apenas as concentrações à -0,8 e -1,0 MPa foram avaliadas no terceiro experimento. Assim, as sementes foram imersas para a embebição à 20ºC por quatro, cinco, seis e sete dias. Em seguida, nós avaliamos to tempo para a primeira ocorrência germinativa (Ti), o tempo para a última (Tf), a porcentagem inicial de plântulas normais (Pi) e a porcentagem final de cada tratamento (Pf). O priming aumentou a porcentagem de plântulas normais e reduziu o tempo para a primeira e última ocorrência germinativa.

ABSTRACT. The foremost factor necessary for plant growers cultivating large acreages of Stevia rebaudiana (Bert) Bertoni is the production of qualitative bedding plants. The objective of this study was to evaluate the influence of osmotic-priming on the uniformity of seed germination. First, we evaluated the percentage of normal seedlings from two seed samples harvested in 2011 and 2012. The seeds harvested in 2012 produced 71.4% normal seedlings and thus they were used in the next experiments. The seeds were subjected to osmotic stress using five concentrations of polyethylene glycol (PEG-6000) at -0.2, -0.4, -0.6, -0.8, and -1.0 MPa in contrast with distilled water. Based on these first results, only -0.8 and -1.0 MPa were evaluated in the third experiment. The seeds were immersed in both concentrations of polyethylene glycol (PEG-6000) for imbibing at 20ºC for four, five, six, and seven days. Thereafter, we evaluated the time to the first normal seedling (Ti), time to the last normal seedling (Tf), percentage normal seedlings at the initial time (Pi) and percentage of normal seedlings at the end of every treatment (Pf). Osmotic priming increased the percentage of normal seedlings of the Stevia rebaudiana and reduced the time to the first and last germination events.

RESUMO. O cancro cítrico, causado pela bactéria Xanthomonas citri subsp. citri é uma das doenças mais importantes da citricultura. A utilização de genótipos resistentes à doença assume um papel importante no manejo e controle do patógeno, sendo essa uma medida viável ao produtor e sustentável ao ambiente. O conjunto de dados utilizado neste trabalho consistiu das observações obtidas de um experimento em que foram empregados como material vegetal, nove genótipos de Laranja doce, variedade Pera enxertado em quatro diferentes porta-enxertos. Este experimento teve inicio em 2010 e foram realizadas avaliações trimestrais para determinar a incidência de cancro nas folhas das plantas. Para a análise dos observações resultantes desse experimento foi utilizado a regressão Beta inflacionada de zero (RBIZ), que é a metodologia adequada para descrever proporções com grandes quantidades de zeros. A partir da análise residual, pode-se perceber que os dados se apresentaram de maneira homogênea indicando um bom ajuste do modelo. Para o componente discreto a variável explicativa, porta enxerto, foi significativa para o não aparecimento da doença, em contraste com o componente contínuo, em que a variável genótipo mostrou-se significativa para explicar a incidência de cancro cítrico.

ABSTRACT. Citrus canker, caused by the bacterium Xanthomonas citri subsp. citri, is one of the most important diseases of citrus. The use of resistant genotypes plays an important role in the management and control of the disease and is the most environmentally sustainable approach to disease control. Citrus canker incidence was recorded in an experiment on nine genotypes of the sweet orange variety 'Pera' grafted on four rootstocks. The experiment was started in 2010 and the incidence of citrus canker on the leaves was recorded on a quarterly basis. The incidence data from the experiment were analyzed using a zero-inflated Beta regression model (RBIZ), which is the appropriate method to describe data with large numbers of zeros. Based on the residual analysis, the data fit the model well. The discrete component of the explanatory variable, rootstock, was not significant as a factor affecting the onset of disease, in contrast with the continuous component, genotype, which was significant in explaining the incidence of citrus canker.

RESUMO. Em diversas áreas do conhecimento, dados com excesso de zeros são encontrados com frequência. Para a análise de tais dados, é recomendado utilizar modelos que permitam uma contagem deste excesso de zero de forma adequada. Neste artigo, o modelo binomial negativo inflacionado de zero (ZINB) foi utilizado para descrever o número de plantas doentes, acometidas por Huanglongbing, em pomares comercias de laranjeiras na região noroeste do Estado do Paraná. Entretanto, deve-se levar em consideração que cada pomar foi avaliado ao longo do tempo, sendo assim, neste contexto, o modelo ZINB com efeito aleatório em ambas as funções de ligação, logarítmica e logística, apresentou melhor ajuste aos dados, pois a introdução destes efeitos consideraram as variações entre os pomares e a dependência entre número de plantas doentes. A partir deste modelo é possível perceber que as plantas mais velhas tendem a apresentar menor probabilidade de adquirir a doença. Todavia, a aplicação de inseticidas e o manejo por calendário apresentam três vezes mais chance de apresentar a doença do que o manejo somente pela presença do vetor.

ABSTRACT. Zero-inflated data from field experiments can be problematic, as these data require the use of specific statistical models during the analysis process. This study utilized the zero-inflated negative binomial (ZINB) model with the log- and logistic-link functions to describe the incidence of plants with Huanglongbing (HLB, caused by Candidatus liberibacter spp.) in commercial citrus orchards in the Northwestern Parana State, Brazil. Each orchard was evaluated at different times. The ZINB model with random effects in both link functions provided the best fit, as the inclusion of these effects accounted for variations between orchards and the numbers of diseased plants. The results of this model show that older plants exhibit a lower probability of acquiring HLB. The application of insecticides on a calendar basis or during new foliage flushes resulted in a three times larger probability of developing HLB compared with applying insecticides only when the vector was detected.

O objetivo deste trabalho foi o de indicar, ou não, distribuições alternativas e assimétricas para a análise de dados que foram obtidos com os testes de germinação, frio e envelhecimento, peso de matéria seca e porcentagem de umidade medidos durante a maturação de sementes de milho. Para isto foi realizada uma análise exploratória dos dados obtidos de um experimento em que foram semeados três híbridos em três épocas distintas e cujas plantas tiveram as espigas amostradas dentro de cada parcela. O intervalo de coleta variou em quatro dias começando após o 23º e terminando no 59º dia após o florescimento. As distribuições estudadas foram a Normal, a Lognormal, a de Gumbel e a de Weibull. O valor numérico do logaritmo da função verossimilhança foi usado como indicativo do grau de ajustamento. Os resultados indicaram que distribuições diferentes da Normal podem ser uma alternativa para dados em porcentagem obtidos durante a maturação. O maior valor do logaritmo da função de verossimilhança foi obtido com o ajuste da distribuição de Gumbel para os dados germinativos em percentagem e a de Weibull para o peso da matéria seca acumulada e porcentagem de umidade.

This exploratory data analysis indicated the alternative use of asymetrical statistical distribution for data analysis from time to flowering until seed maturation is achieved. It was used data from the seed germination test, vigor tests, moisture content and seed dry weight as dependent variables. The hybrids corn seeds were planted in three diferent times of seeding and samples of plants were taken in each plot. The time interval of four days between each sample was used, starting in the 23rd and finishing in the 59th. The Normal, Lognormal, Gumbel and Weibull distribution was used to determine the highest numerical value of the loglikelihood as a test of goodness of fit. The highest numerical value of the loglikelihood was provided by the Gumbel distribution fit to the proportional data set but the seed dry weight and water content had a best fit to the Weibull distribution.